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短信通知注销了是否扣钱以及如何处理，很大程度上取决于具体的情境和服务协议。
如果短信通知服务是银行或其他机构提供的一项有偿服务，那么在注销这项服务时，通常不会额外扣费，如果已经注销了这项服务，但仍然收到了扣费通知，这可能是一个错误或者是一些特殊情况。
面对这种情况，可以采取以下步骤处理：
1、查明原因：弄清楚为什么会被扣费，是因为服务没有真正被取消，还是由于其他未知的原因。
2、联系服务提供商：如果确认是服务方的错误，或者对扣费原因存在疑问，可以联系相应的银行或机构，解释情况并寻求解决方案。
3、申请退款：如果是服务提供商的错误导致的不当扣费，可以请求其退款。
4、保留证据：保留所有相关的短信通知、账单和记录，以备不时之需。
仅供参考，具体的扣费情况和处理方式可能会因不同的银行或服务提供机构而有所不同，如果仍然不确定如何处理，建议直接联系相关的服务机构或者专业律师进行咨询。